Universitas Flores terus maju dan berkembang memberikan pelayanan kepada masyarakat terutama generasi muda.Setelah melalui pertimbangan yang matang dan sesuai permintaan masyarakat se-daratan Flores dan setelah diadakan penelitian dan studi kelayakan oleh sebuah tim dari Universitas Flores, yang ditetapkan dengan keputusan Kopertis Wilyah VIII Denpasar, maka sesuai data-data yang di kumpulkan oleh Tim Studi kelayakan dan sesuai ketentuan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan RI dan Dirjen Dikti tentang usul membuka Fakultas Ekonomi dan Program studi Baru maka Ketua Umum YAPERTIF menghadap Dirjen Dikti dengan mambawa semua Kelengkapan yang di haruskan, memohon untuk membuka Fakultas Ekonomi dengan jurusan Ekonomi Manajemen, Jurusan Ekonomi Akuntansi, dan Jurusan Ekonomi Studi Pembangunan.
Setelah diteliti semua bahan-bahan terutama lampiran-lampiran dalam berkas yang diajukan, maka Dirjen Dikti menetapkan Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia, Nomor: 39/DIKTI/Kep/1998 tanggal 11 Februari 1998 tentang pemberian status “Terdaftar” kepada 2 program studi pada Fakultas Ekonomi di Lingkungan Universitas Flores di Ende. Dengan keputusan itu, YAPERTIF membuka Fakultas Ekonomi Universitas Flores, Jurusan Ekonomi Manajemen dan Jurusan Ekonomi Akuntansi.
Visi dan Misi Fakultas Ekonomi Uniflor
Visi Fakultas Ekonomi yakni Mendidik dan Mencerdaskan calon Sarjana Ekonomi yang professional dan berjiwa wirausaha serta menguasai dasar-dasar Ilmiah Ekonomi. Sementara Misi Fakultas Ekonomi adalah Mengembangkan kualitas sarjana yang menguasai Ilmu pengetahuan, teknologi, dan terampil dalam berwirausaha.
LEMBAGA PENELITIAN UNIVERSITAS FLORES 